公司因此扣了我的全勤奖，这合理吗？

公司扣全勤奖需视规定而定。依据《劳动合同法》，公司可制定规章制度管理员工，忘记打卡按公司规定处理，若无合理解释可能面临罚款或扣奖，影响个人收入。
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常见处理方式为书面解释或按公司规定接受处罚。若确实忘记打卡，应及时书面解释并提交证明，争取免于处罚；若无法证明，则按公司规定接受相应处理。
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忘打卡处理看规定。操作：1.忘打卡后，立即书面解释情况，并找领导签字证明；2.若当天无法说明，最迟24小时内补交证明及同事签字；3.若无法证明，接受公司按规定扣罚全勤奖或工资。